Les collections du musée s'articulent autour de quatre thèmes principaux. Le Moyen Age et la première croisade sont évoqués à travers d'objets d'art et de la vie quotidienne, des armes... illustrant l'Orient et l'Occident. L'histoire du duché de Bouillon du Moyen Age à la Révolution française rappelle le passé à la fois riche et tumultueux de cette petite principauté souveraine. Le passé industriel de Bouillon, qui vécut durant un siècle au rythme des usines métallurgiques qui y étaient installées. La vie et les métiers traditionnels de l'Ardenne et de la vie rurale autrefois sont évoqués à travers des reconstitutions d'intérieurs et d'anciens ateliers artisanaux. En outre, les collections comprennent un nombre important d'oeuvres des peintres Albert Raty et Guillaume Edeline.